毛细管色谱柱特点是高的柱效，但是必须清楚一般所测得的柱效不仅反映了柱的质量，而且还包括进样过程的整个系统的效率的总质量，也就是说，自样品进入系统的一瞬间开始到记录笔绘出色谱峰为止，每一个能影响峰的加宽或分离的因素，如进样器、柱的连接、辅助气引入位置、管路死体积、进样器内衬的毛病等等，都一定会影响柱效。毛细管色谱柱大体可以分为开管型毛细管柱及填充型毛细管柱这两种类型。开管型毛细管柱的渗透性好，分析速度快。因无涡流扩散项，且传质阻力小，所以柱效高，理论板数可达106。但因其柱容量低，进样量少，常需采用分流器进行分流进样。毛细管色谱柱由柱管、压帽、卡套(密封环、筛板(滤片)、接头、螺丝等组成，其两端的柱接头内装有筛板。

毛细管气相色谱仪特点：

一、渗透性好：一般毛细管的比渗透率约为填充柱的100倍，在同样的柱前压下，可使用更长的毛细管柱，而载气的线速可保持不变。

二、传质快，有利于提高柱效。毛细管柱的液膜厚度小，柱效高，柱渗透性大，因此可采用较高流速，缩短气相色谱仪分析时间。

三、总柱效高：从单位柱长的柱效看，毛细管柱和填充柱处于同一数量级，但毛细管柱的长度比填充柱长，因此其总柱效远高于填充柱，提高分离复杂混合物的能力。总之，毛细管柱渗透性大，可采用长柱子和高载气流速缩分析技术，使其保持高柱效和快速分离。

四、柱容量小：毛细管柱允许的进样量较小，对进样技术和检测技术要求更高，需要与气相色谱仪采用分流进样和尾吹气路。